Program Studi Akuntansi telah ada sejak awal berdirinya Fakultas Ekonomi Unwahas pada tahun 2000.
Saat ini, Program Studi Akuntansi Unwahas telah mendapatkan akreditasi B dan memiliki empat pilihan konsentrasi, yaitu:

Akuntansi Keuangan
Akuntansi Manajemen
Akuntansi Keuangan Syariah
Akuntansi Syariah